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遗传性胶质瘤的性别特异性基因和通路

2021-09-06 王文佳 高谋 邱天明

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目前,全基因组关联分析研究已经确定25个胶质瘤相关的基因风险变异,可解释30%的遗传风险。




































































































































美国俄亥俄州克利夫兰凯斯西储大学医学院凯斯综合癌症中心的Quinn T. Ostrom等基于前期GWAS确定的胶质瘤性别特异性变异,建立基因和通路模型,以进一步阐明胶质瘤的性别特异性;结果发表于2019年1月《Neuro-Oncology》杂志。


——摘自文章章节


【Ref: Ostrom QT, et al. Neuro Oncol. 2019 Jan 1;21(1):71-82. doi: 10.1093/neuonc/noy135.】


研究背景




目前,全基因组关联分析研究(GWAS)已经确定25个胶质瘤相关的基因风险变异,可解释30%的遗传风险。绝大多数组织学研究结果表明,胶质瘤男性的发病率高于女性,然而具体因素尚不清楚。美国俄亥俄州克利夫兰凯斯西储大学医学院凯斯综合癌症中心的Quinn T. Ostrom等基于前期GWAS确定的胶质瘤性别特异性变异,建立基因和通路模型,以进一步阐明胶质瘤的性别特异性;结果发表于2019年1月《Neuro-Oncology》杂志。


研究方法



研究者以胶质瘤国际病例对照的研究结果作为测试队列,以3个GWAS研究荟萃分析结果作为验证队列。汇总常染色体单核苷酸多态性(SNP)(p<0.01)和X染色体SNP(p<0.01)统计数据,基于Pascal、BimBam和GATES三种算法进行基因评分,并依据Pascal算法进行通路评分。


研究结果



研究结果指出,男性在5个区域内有25个基因,女性在6个区域内有19个基因具有统计学意义。在所有胶质瘤和胶质母细胞瘤中,表皮生长因子受体(EGFR)仅存在男性特异性关联,而端粒酶逆转录酶(TERT)存在女性特异性关联。在以已知的风险位点为条件,这些性别特异性风险变异仍然明显。此外,两种性别中,Biocarta端粒、端粒酶、细胞衰老和永生等通路在名义上存在显著相关性。


结论



该研究对已确定的单核苷酸多态性进行质控,发现两种性别患者的RTEL1遗传变异在名义上存在显著相关性。另外,端粒维持通路遗传变异也存在显著相关性。EGFR具有男性特异性关联,TERT具有女性特异性关联。该研究为胶质瘤遗传风险存在性别差异提供更多证据,有助于深入揭示胶质瘤的发生机制。


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